Korallengenom enthüllt Cystein-Überraschung

Newswise — Modelltiere wie Mäuse und Fruchtfliegen haben Wissenschaftlern beeindruckende Einblicke in die Funktionsweise der Zellbiologie geliefert. Modelltiere sind jedoch wirklich nur ein Leitfaden, und es kann riskant sein, Ergebnisse aus der Untersuchung einer Auswahl von Modellorganismen auf Tiere zu verallgemeinern

Cystein ist eine wichtige Aminosäure, die in mehreren biologischen Prozessen verwendet wird, einschließlich Stoffwechsel und Proteinsynthese. Bei Tieren wurde angenommen, dass die Cystein-Biosynthese ausschließlich über den Transsulfurierungsweg erfolgt, wobei das Enzym Cystathionin-β-Synthase (CBS) eine Schlüsselrolle spielt. Frühere Untersuchungen zeigten jedoch, dass die CBS Gen war in Korallen der Gattung verloren gegangen Acropora. Der Vorschlag war, dass diese Korallen Cystein nicht selbst produzieren könnten und sich auf symbiotische Beziehungen mit Algen verlassen müssten, um es zu erhalten.

„Wir haben nicht nach einer möglichen Cystein-Biosynthese gesucht Acropora“, sagt Postdoc Octavio Salazar, der an einem Centre Partnership Fund-Projekt mit Principal Investigator Manuel Aranda von KAUST und Mitarbeitern des Australian Institute of Marine Science gearbeitet hat. „Wir generierten ein qualitativ hochwertiges Genom der Koralle Acropora loripes als wertvolle genomische Ressource für die zukünftige Forschung.“

Nachdem das hochauflösende Genom vollständig war, beschloss das Team zu sehen, ob es dies bestätigen könnte CBS Das Gen fehlte tatsächlich. Salazar konnte an der Stelle, an der es sein sollte, keine Spur des Gens finden, aber er und seine Kollegen waren nicht davon überzeugt, dass die Koralle keine andere Möglichkeit hatte, Cystein zu synthetisieren.

„Ich begann, das Genom nach Genen zu durchsuchen, die für Enzyme kodieren, die denen in anderen bekannten Cystein-Biosynthesewegen ähnlich aussahen, wie denen, die in Pilzen und Bakterien vorkommen“, sagt Salazar. „Ich war ziemlich überrascht, zwei Enzyme in der Koralle zu finden, die Ähnlichkeiten mit einem kürzlich identifizierten alternativen Cystein-Biosyntheseweg in Pilzen aufweisen.“

Um zu bestätigen, dass die von diesen Korallengenen codierten Enzyme Cystein synthetisieren können in vivoverwendeten die Forscher Hefemutanten ohne Cystein-Biosynthesefähigkeit und gaben ihnen die entsprechenden Acropora Gene. Die Mutanten begannen, Cystein zu produzieren.

Darüber hinaus fand das KAUST-Team heraus, dass beide Gene in den Genomen aller Tierstämme vorhanden waren, mit Ausnahme von Wirbeltieren, Arthropoden und Nematoden – genau die drei Gruppen, aus denen die häufigsten tierischen Modellorganismen stammen.

„Diese Studie beweist, wie wichtig es ist, offen zu bleiben, wenn es darum geht, Lebewesen zu studieren“, sagt Aranda. „Manchmal kann dich Wissen in eine Schublade stecken; Wenn Sie Daten nur anhand dessen analysieren, was Sie zu wissen glauben, verpassen Sie möglicherweise etwas. Unser Acropora Genom wird für zukünftige Studien von großem Wert sein und wer weiß, es könnte auf dem Weg weitere unerwartete Details enthüllen.“

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